第1話「ガッチャマン対タートル・キング」
世界各国で謎の巨大メカに貯蔵庫が襲われ、ウランが奪われるという事件が発生。国際科学技術庁（通称ＩＳＯ）の南部博士は、この事件が世界征服を企む悪の組織ギャラクターの仕業であると推測。健、ジョー、ジュン、
第1話「総裁Ｘの逆襲」
忍者隊の活躍によって敗れ去った総裁Ｘは、染色体に異常のあった一人の子供を誘拐し急成長させ、新首領ゲルサドラとして就任させた。
第1話 新たなる暗雲
科学忍者隊の働きによりギャラクターは壊滅し、世界には束の間の平和が訪れていた。しかしエゴボスラー伯爵率いる悪の組織エゴボスラー･ファミリーが、世界征服を狙い活動を開始。圧倒的な武力によって、世界を征服